El duatlón dispone de varias distancias oficiales reconocidas por World Triathlon, la federación internacional, que permiten adaptar la exigencia de la prueba al nivel y objetivos de cada atleta.
Duatlón Sprint
La distancia sprint es la más corta de las modalidades oficiales y la más habitual en pruebas de iniciación y circuitos locales. El formato clásico consiste en 5 km de primera carrera, 20 km en bicicleta y 2,5 km de segunda carrera. El tiempo de finalización de los mejores élites ronda los 50-60 minutos, mientras que los atletas amateur pueden completarla en 60-100 minutos.
Duatlón Olímpico o Estándar
El formato olímpico es la distancia de referencia del Campeonato del Mundo y los principales campeonatos nacionales. Se compone de 10 km de primera carrera, 40 km en bicicleta y 5 km de segunda carrera. Requiere una preparación física considerable, ya que la segunda carrera se disputa con el acúmulo de fatiga de los segmentos anteriores.
Duatlón de Media y Larga Distancia
Las pruebas de larga distancia varían según el organizador, pero un formato extendido habitual incluye 10-20 km de carrera, 60-80 km en bicicleta y 5-10 km de carrera final. Algunas pruebas de ultrafondo pueden extenderse más. Estas distancias exigen una planificación nutricional cuidadosa y un entrenamiento específico de muchas semanas.
Duatlón Cross
El duatlón cross es una modalidad de campo a través con los mismos tres segmentos pero en terreno no asfaltado. Las distancias son menores debido a la mayor dificultad del terreno. World Triathlon organiza su propio Campeonato del Mundo de Duatlón Cross.
Formatos de Relevo
Existe también el formato de relevos, donde un equipo de dos o tres atletas se reparte los segmentos. Los relevos mixtos (hombre y mujer) son especialmente populares en los campeonatos internacionales y fomentan la participación igualitaria.