El segmento de carrera a pie en el duatlón se divide en dos partes: la primera carrera (Run 1), que abre la competición, y la segunda carrera (Run 2), que la cierra tras el segmento de ciclismo. Ambas están reguladas por normas específicas que el atleta debe conocer.
La Salida
La primera carrera comienza con una salida en línea o en oleadas según el formato de la prueba. En competiciones de élite la salida suele ser simultánea. En pruebas amateur y age group es habitual la salida por oleadas según categoría de edad o tiempo estimado. El atleta debe colocarse en el cajón de salida correcto bajo pena de penalización.
Durante la Carrera
El atleta debe completar el recorrido marcado por la organización sin atajos ni salirse del circuito señalizado. El dorsal debe ser visible en todo momento, habitualmente en la parte delantera del cuerpo mediante un portadorsales. Está prohibido recibir asistencia externa en el circuito salvo en los puntos de avituallamiento habilitados.
Entrada y Salida de la Zona de Transición
Al finalizar la primera carrera, el atleta entra en T1 (primera transición) por el carril indicado. Debe acceder a su puesto de bicicleta caminando o corriendo, pero no puede montar en la bici hasta cruzar la línea de montaje. Al terminar el segmento de ciclismo, entra en T2 y continúa a pie hasta la línea de llegada.
Llegada
La segunda carrera finaliza cruzando la línea de meta. El atleta debe llegar bajo sus propios medios y en todo momento mantener el dorsal visible. Algunos reglamentos exigen que el chip de cronometraje permanezca en el tobillo hasta que el oficial de meta lo retire.
Causas de Descalificación
Las principales causas de descalificación durante la carrera son: atajar el recorrido, recibir asistencia no permitida, comportamiento antideportivo hacia otros competidores y no llevar el dorsal visible. Las infracciones menores pueden conllevar penalizaciones de tiempo.